Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC0

HCAR1, Hydroxycarboxylic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR1Q9BXC0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HCAR1Q9BXC0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCAR1Q9BXC0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HCAR1Q9BXC0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCAR1Q9BXC0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCAR1Q9BXC0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HCAR1Q9BXC0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HCAR1Q9BXC0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms