Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B5Q9BWJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SF3B5Q9BWJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms