Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUP58Q9BVL2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms