Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF7

CRB3, Protein crumbs homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB3Q9BUF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRB3Q9BUF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRB3Q9BUF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRB3Q9BUF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms