Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2AFJQ9BTM1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2AFJQ9BTM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFJQ9BTM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms