Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM175Q9BSA9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM175Q9BSA9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM175Q9BSA9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms