Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TXNDC17Q9BRA2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms