Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LYSTQ99698 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYSTQ99698 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms