Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EYA3Q99504 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EYA3Q99504 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
EYA3Q99504 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EYA3Q99504 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms