Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNL2Q96S94 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNL2Q96S94 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNL2Q96S94 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL2Q96S94 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms