Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HHIPQ96QV1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HHIPQ96QV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHIPQ96QV1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms