Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRRIQ1Q96JM4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
LRRIQ1Q96JM4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRRIQ1Q96JM4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
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