Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAX2Q96IS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAX2Q96IS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAX2Q96IS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAX2Q96IS3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAX2Q96IS3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAX2Q96IS3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms