Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms