Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHFRQ96EP1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHFRQ96EP1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms