Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHISA4Q96DD7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHISA4Q96DD7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SHISA4Q96DD7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SHISA4Q96DD7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1649.6 ms