Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW9

TAMM41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAMM41Q96BW9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAMM41Q96BW9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TAMM41Q96BW9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAMM41Q96BW9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.3 ms