Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP13Q92995 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP13Q92995 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP13Q92995 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP13Q92995 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP13Q92995 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP13Q92995 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP13Q92995 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP13Q92995 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP13Q92995 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP13Q92995 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP13Q92995 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP13Q92995 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP13Q92995 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP13Q92995 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP13Q92995 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP13Q92995 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP13Q92995 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP13Q92995 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP13Q92995 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP13Q92995 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP13Q92995 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP13Q92995 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP13Q92995 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP13Q92995 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP13Q92995 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP13Q92995 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP13Q92995 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP13Q92995 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP13Q92995 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP13Q92995 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP13Q92995 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP13Q92995 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP13Q92995 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP13Q92995 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP13Q92995 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP13Q92995 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP13Q92995 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP13Q92995 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP13Q92995 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP13Q92995 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP13Q92995 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP13Q92995 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP13Q92995 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP13Q92995 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP13Q92995 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP13Q92995 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP13Q92995 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP13Q92995 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP13Q92995 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP13Q92995 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP13Q92995 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP13Q92995 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP13Q92995 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP13Q92995 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP13Q92995 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP13Q92995 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP13Q92995 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP13Q92995 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP13Q92995 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP13Q92995 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP13Q92995 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP13Q92995 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP13Q92995 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP13Q92995 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP13Q92995 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP13Q92995 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP13Q92995 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP13Q92995 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP13Q92995 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP13Q92995 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP13Q92995 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP13Q92995 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP13Q92995 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP13Q92995 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP13Q92995 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP13Q92995 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms