Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGGTAQ92696 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RABGGTAQ92696 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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