Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BAP1Q92560 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BAP1Q92560 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BAP1Q92560 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BAP1Q92560 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms