Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCAF4Q8WV16 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF4Q8WV16 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms