Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP25Q8TEE9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP25Q8TEE9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SAP25Q8TEE9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAP25Q8TEE9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms