Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GNPDA2Q8TDQ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GNPDA2Q8TDQ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms