Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDCSPQ8NFU4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FDCSPQ8NFU4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FDCSPQ8NFU4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms