Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP32Q8NFA0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
USP32Q8NFA0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP32Q8NFA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP32Q8NFA0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP32Q8NFA0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP32Q8NFA0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP32Q8NFA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP32Q8NFA0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.8 ms