Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIBP2Q8ND30 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPFIBP2Q8ND30 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms