Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC54

KCT2, Keratinocyte-associated transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCT2Q8NC54 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCT2Q8NC54 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCT2Q8NC54 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms