Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL23Q8NBE8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL23Q8NBE8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL23Q8NBE8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL23Q8NBE8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms