Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM1BQ8NB78 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM1BQ8NB78 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM1BQ8NB78 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms