Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MFSD2AQ8NA29 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MFSD2AQ8NA29 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms