Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNYL1Q8N7R7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNYL1Q8N7R7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms