Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00612Q8N6U2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185 ms