Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC51AQ86UW1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC51AQ86UW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC51AQ86UW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC51AQ86UW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms