Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM73Q86UV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM73Q86UV7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM73Q86UV7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM73Q86UV7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms