Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC11Q7Z392 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC11Q7Z392 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms