Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP3Q7RTS5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP3Q7RTS5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OTOP3Q7RTS5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTOP3Q7RTS5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms