Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYS1Q717R9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYS1Q717R9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYS1Q717R9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms