Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP47Q6ZTR5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP47Q6ZTR5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms