Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC73Q6ZRK6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC73Q6ZRK6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC73Q6ZRK6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms