Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CD109Q6YHK3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CD109Q6YHK3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CD109Q6YHK3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CD109Q6YHK3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms