Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNT2Q6UVM3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNT2Q6UVM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNT2Q6UVM3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms