Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC27A1Q6PCB7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC27A1Q6PCB7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A1Q6PCB7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms