Protein–RNA interactions for Protein: Q6P474

PDXDC2P, Putative pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC2PQ6P474 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDXDC2PQ6P474 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDXDC2PQ6P474 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDXDC2PQ6P474 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDXDC2PQ6P474 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDXDC2PQ6P474 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms