Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RALGAPA1Q6GYQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RALGAPA1Q6GYQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RALGAPA1Q6GYQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms