Protein–RNA interactions for Protein: Q68D42

TMEM215, Transmembrane protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM215Q68D42 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM215Q68D42 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM215Q68D42 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM215Q68D42 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms