Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LPCAT4Q643R3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LPCAT4Q643R3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4Q643R3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms