Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
CARMIL1Q5VZK9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CARMIL1Q5VZK9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CARMIL1Q5VZK9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CARMIL1Q5VZK9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms