Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ECM29Q5VYK3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECM29Q5VYK3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECM29Q5VYK3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms