Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NUP188Q5SRE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NUP188Q5SRE5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
NUP188Q5SRE5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms