Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MIA3Q5JRA6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MIA3Q5JRA6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MIA3Q5JRA6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms